2017 – IDENTIFICAZIONE DI NUOVI GENOTIPI EUROPEI DEL VIRUS DELL’INFLUENZA SUINA IN ITALIA TRA IL 2013 E 2016
Parole chiave: influenza suina, genotipi
La sorveglianza passiva condotta nelle regioni di Veneto e Friuli Venezia tra il 2013 e il 2016 ha identificato un totale di sette allevamenti virologicamente positivi al virus dell’influenza suina (SIV), localizzati in nove differenti comuni di 4 diverse province. In alcuni allevamenti ripetuti focolai respiratori si sono registrati.
Il consorzio europeo per la sorveglianza di virus influenzali suini (European Surveillance Network for in influenza in pigs – ESNIP) ha caratterizzato geneticamente i virus circolanti nei Paesi aderenti al consorzio tra 2009 e 2013, creando una classificazione univoca (Watson et al., 2015). In totale, a seguito della cartterizzazione di 290 virus, venticinque genotipi sono stati identificati e identificati da A a W.
Nel presente lavoro il genoma completo di 14 virus identificati tra il 2013 e il 2016 in Veneto e Friuli Venezia Giulia è stato caratterizzato mediante Illumina MiSeq, per identificare i genotipi circolanti nel suddetto territorio.
L’analisi filogenetica ha identificato due virus pandemici (A(H1N1)pdm09), 5 virus human- like H1N2 (H1huN2) e 5 avian-like H1N2 (H1avN2), 1 avian-like H1N1 (H1avN1) e 1 virus di sottotipo H3N2. In totale sono stati identificati 6 differenti genotipi, secondo la recente classificazione, tra cui 1 mai identificato e segnalato in Europa precedentemente.
La sorveglianza e l’identificazione dei genotipi circolanti consente di individuare la presenza di nuovi genotipi o l’introduzione di nuovi genotipi in Paesi e aree precedentemente indenni. Considerando il potenziale zoonosico di questi virus tale attività si dimostra necessaria per monitorare l’emergenza di virus con potenziale pandemico.
